계통운전 절차가 개선된 붕산농축기 계통 운영 시스템 및 방법이 제공된다. 본 발명의 실시예에 따른 계통운전 절차가 개선된 붕산농축기 계통 운영 시스템은, 보조증기를 이용하여 저농도 붕산 순환수를 가열하는 BAC 히터(Heater); BAC 히터에 보조증기를 공급하는 보조증기 공급 라인; 보조증기 공급 라인의 개폐를 제어하는 입력단 밸브; BAC 히터에서 사용된 보조증기가 배출되는 보조증기 배출 라인; 보조증기 배출 라인의 개폐를 제어하는 출력단 밸브; 및 입력단 밸브 및 출력단 밸브를 제어하여 공급되는 보조증기의 압력과 배출되는 보조증기의 압력 간 차압이 기설정되는 계통운전 조건에 따라 일정하게 유지되도록 하는 제어부;를 포함한다. 이에 의해, BAC 히터(Heater)의 열전달 능력을 향상시키기 위해, 계통운전 절차를 개선하여, BAC 계통 및 기기 안전성 확보에 기여할 수 있다.